In den letzten Jahren erhielt das Archäologische Spessartprojekt zahlreiche Belobigungen und Auszeichnungen für die von ihm initiierten, konzipierten oder durchgeführten Projekte:
- Tegernseer Tourismuspreis 2006
- Carl-Gottfried-Scharold-Preis 2008
- Bayerischer Archäologiepreis 2012
- Deutscher Preis für Denkmalschutz 2014
Darüber hinaus konnten sich zahlreiche durch das Spessartprojekt initiierte Projekte über Preisverleihungen freuen:
2007: Preis der Unterfränkischen Gedenkjahrstiftung für Wissenschaft an Dr. Jürgen Jung
2013: Preis der Unterfränkischen Gedenkjahrstiftung für Wissenschaft an Dr. Florian Huggenberger
2014: Archivpreis des Landes Hessen an Dr. Gerrit Himmelsbach